jueves, 20 de noviembre de 2014

¿Por qué CRISPR no funciona en E. coli?

Reproduzco traducido el artículo de Elio publicado en el blog "Small Things Considered" de la ASM.
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Udi Qimron en su laboratorio del Departamento de microbiología humana dela Universidad de Tel Aviv
Según Udi Qimron, un genetista microbiólogo y experto en CRISPR la razón de que no funciona CRISPR en E. coli es sencillamente que no funciona. Según este experto, el sistema CRISPR-Cas está en E. coli inactivado debido al regulador H-NS (codificado por el gen hns). Los pasos del sistema CRISPR de adaptación e interferencia están reprimidos por la presencia de H-NS. 

Por esta razón el sistema no adquiere de forma natural nuevos espaciadores procedentes de nuevos fagos, y si por lo que sea, el sistema adquiriese nuevos espaciadores no se podrían expresar porque algunas proteínas de interferencia importantes no se expresarían. Por lo tanto la resistencia de E. coli a ser invadida por fagos se tiene que conseguir por otros medios, por ejemplo mutaciónes (como en el caso del fago LamB). Por esta razón no existen cepas de E. coli en la naturaleza que se puedan proteger de los fagos utilizando CRISPR-Cas. Si empleamos un mutante hns- se podría revertir este fenotipo en el plazo de dos semanas consiguiendo protección contra plásmidos y potencialmente también contra fagos persistentes tales como el M13.

En otras bacterias como por ejemplo Streptococcus thermophilus, el sistema CRISPR funciona como el sistema de defensa dominante

REFERENCIAS:
Phys Life Rev. 2014 Mar;11(1):146-8; discussion 149-51 2013 Dec 12.
CRISPR-Cas: outstanding questions remain: comment on "Diversity, evolution, and therapeutic applications of small RNAs in prokaryotic and eukaryotic immune systems" by Edwin L. Cooper and Nicola Overstreet.
Severinov K.

Science. 2007 Mar 23;315(5819):1709-12.
CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes.
Barrangou R1, Fremaux C, Deveau H, Richards M, Boyaval P, Moineau S, Romero DA, Horvath P.

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